道馆是玩家挑战馆主、获取徽章的关键地点，分布在关都地区的各个城市。第一个道馆位于尼比市，馆主小刚使用岩石系宝可梦，玩家需从真新镇出发，经过常磐森林后抵达。尼比市道馆的布局以岩石障碍为主，需注意大岩蛇的高防御力。
第二个道馆位于华蓝市，馆主小霞擅长水系宝可梦。从尼比市向东穿过月见山即可到达。华蓝道馆内部设有水流机关，需利用冲浪技能或绕路前进。第三个道馆在枯叶市，馆主马志士使用电系宝可梦，道馆内需解开垃圾桶机关才能挑战馆主。枯叶市可通过圣安奴号船票抵达，道馆的电气陷阱需谨慎应对。
第四个道馆位于彩虹市，馆主莉佳使用草系宝可梦。从枯叶市向北经地下通道到达。彩虹道馆内有大量隐藏传送点，需反复尝试路线。第五个道馆在紫苑镇附近的浅红市，馆主阿桔使用毒系宝可梦，道馆以隐形墙壁为特色，需凭记忆或试探前进。浅红市需从彩虹市向西穿越地下通道抵达。
第六个道馆位于山野市（沙吉市），馆主娜姿使用超能系宝可梦。从浅红市向南经12号道路到达。山野道馆的迷宫需通过传送面板破解，建议提前存档。第七个道馆在红莲岛，馆主夏伯使用火系宝可梦，需从枯叶市乘船抵达。红莲道馆的谜题涉及机关和推石，需耐心解谜。
最后一个道馆位于常磐市，馆主坂木使用地面系宝可梦。需集齐七枚徽章后返回初始城市挑战。常磐道馆的机关需按特定顺序触发，馆主的宝可梦等级较高，建议提前练级。完成全部道馆挑战后，玩家即可获得参加宝可梦联盟的资格。
