水路的正确方向需要通过合理使用冲浪技能和地图标记来定位。首先确保队伍中有掌握冲浪技能的宝可梦，这是探索水路的基础条件。从枯叶市码头出发，使用船票登上圣安奴号，完成船上剧情后获得秘传机01居合斩，随后返回枯叶市右侧水域开始冲浪。水路的路径通常以岛屿或海岸线为参照物，例如从枯叶市向东冲浪可抵达1号岛的灯火山，而向南则通往双子岛。注意观察地图上的礁石分布和陆地轮廓，这些是判断方向的重要依据。
水路探索中常遇到的障碍是漩涡和暗流，它们会强制改变行进路线。解决方法是携带拥有清除浓雾技能的宝可梦，或提前在紫苑镇宝可梦塔获取秘传机05闪光以照亮黑暗区域。若在双子岛附近迷失，需推动洞穴内的岩石堵住瀑布水流，这是抵达急冻鸟栖息地的关键步骤。无人发电厂附近的浅滩区域可通过特定水道绕行，但需避开野生高等级宝可梦的遭遇。
狩猎地带是水路中的重要地标，其入口位于浅红市右侧水域。该区域的水路呈网状结构，建议以中央湖泊为圆心向外探索。狩猎地带内部分岔路会通向隐藏道具或稀有宝可梦，例如水之石和迷你龙。若需返回主线路，只需沿水流逆时针方向移动至出口。7号岛屿的子岛需通过特定潮汐时间才能进入，需反复尝试冲浪路径。
后期水路的难点在于红莲岛周边海域，此处需结合潜水技能深入海底洞穴。潜水点通常以深色水域为标识，浮出水面时会到达隐藏岛屿或神兽巢穴。例如火焰鸟所灯火山需从1号岛北侧潜水点下潜，穿过熔岩隧道后浮出。若多次尝试未果，可参考游戏内NPC对话提示，如枯叶市水手会提及东北方的火山影子。
最终确认方向正确性的方法是检查徽章收集进度。第七枚徽章所在地羽毛市需穿越海神岩南部水域，而第八枚徽章关联的岛屿间航线需完成三圣鸟捕获任务。若长时间未触发剧情，建议回溯水路起点重新确认关键道具是否获取，如船票或宝石。系统性的方向判断需结合陆地探索与水路推进，不可仅依赖单一水域路径。
