口袋妖怪火红中，图鉴收集的阶段性奖励分布在真新镇、各道路闸口与玉虹市，完成关都图鉴与全国图鉴的最终奖励则在玉虹大厦3楼的GAMEFREAK开发室领取，过程中每达成一定收集数量即可解锁对应道具与功能。
图鉴收集初期，当登录宝可梦数量达到10只时，通过地鼠洞穴返回2号道路，在道路旁的民居内与研究员对话，能获取秘传学习器05闪光，有了这个技能，就能轻松探索黑暗的岩石隧道等场景。收集至30只宝可梦时，前往11号道路的闸口，找到大木博士的助手，可领取探宝器，这个道具能探测脚下隐藏的道具，对后续收集金币、进化石等资源至关重要。达到40只时，在16号道路与玉虹市之间的闸口内，能从助手处获得护符金币，携带后对战可获得双倍金钱，大幅提升刷钱效率。收集50只宝可梦后，前往15号道路闸口，助手会赠送学习装置，让未参战的宝可梦也能平分经验，是快速培养新宝可梦的核心道具。
当图鉴收录宝可梦超过60种，且完成一周目主线成为联盟冠军后，回到真新镇的大木研究所，大木博士会自动将关都图鉴升级为全国图鉴，解锁386种宝可梦的收录权限，同时开启七岛的探索剧情。升级图鉴后，前往枯叶市码头乘船前往一之岛，推进七岛剧情，收集红宝石与蓝宝石，完成网络中心的设备修复，才能完整解锁全国图鉴的收集条件。
完整集齐关都地区151种宝可梦（不含梦幻）后，前往玉虹市的玉虹大厦，乘坐电梯抵达3楼，进入GAMEFREAK开发室，与室内的游戏设计师对话，会获得关都图鉴完成奖状，同时训练家卡片会升级，彰显图鉴收集的成就。若进一步集齐全部386种全国图鉴宝可梦，再次前往开发室，可领取全国图鉴完成奖状，这是游戏中图鉴收集的最高荣誉，虽无实质战斗道具，但象征着宝可梦训练师的极致收集成就。
图鉴收集过程中，可通过野外捕捉、NPC交换、进化、孵蛋等方式补充缺失种类，七岛的草丛、水域、洞穴分布大量关都地区没有的宝可梦，是补充全国图鉴的关键区域。同时，合理利用探宝器、学习装置等奖励道具，能提升收集效率，护符金币则能快速积累资金，购买精灵球与回复道具，支撑长期的野外探索与捕捉行动。
